Народився у 1931 році в м. Тбілісі (Грузія). Закінчив Сходознавчій факультет Тбіліського державного університету в 1955р. З 1951 року почав працювати в школі піонервожатим, учителем праці, історії. У 1958 році став кандидатом педагогічних наук. У 1974 році захистив докторську дисертацію з психології на Вченій Раді Інституту психології (м. Москва). Довгий час працював у Грузії в НДІ педагогіки імені Я.С. Гогебашвілі: лаборантом, науковим співробітником, завідувачем лабораторією експериментальної дидактики, заступником директора, директором, генеральним директором створеного ним же Науково-виробничого педагогічного об'єднання.
З 1964 р. з колегами проводить масовий експеримент у школах багатьох районів Грузії. На базі детального дослідження була створена нова педагогічна система, відома зараз як гуманно-особистісна педагогіка. Система ця спирається на припущення: про реальність Вищої Свідомості, про безсмертя духу і про земне життя, як про шлях сходження духовного світу людини. На цих припущеннях і на основі психології будується піднесений погляд на дитину: дитина - явище в земному житті, носій свого призначення (місії), в нєї необмежена енергія духу. З багатої психологічної природи Дитини особлива увага приділяється: пристрасті до розвитку, до дорослішання, до свободи. Гуманно-особистісна педагогіка вибудовує свої принципи, методи, спілкування з Дитиною, погляд на Вчителя, можливості одухотворення змісту освіти, понятійну основу виходячи зі своєї духовно-філософської та психологічної основи. Система гуманно-особистісного підходу до дітей в освітньому процесі рекомендована Міністерством освіти РФ для масового застосування в роботі шкіл.
Головні книги Ш.О. Амонашвілі: «Школа життя», «Роздуми про Гуманну Педагогіку», «Виховна та освітня функція оцінки навчання школярів», «До школи з 6 років», «Здрастуйте, діти!», «Як живете, діти?», «Єдність мети », а також художні твори: «Амон-Ра»,«Саломея»,«Вся земля чекає нас»,«Нехай у темряві сяє світло»,«Рука ведуча» та ін. Книги видані в різних видавництвах на багатьох мовах світу.
Ш.О. Амонашвілі обраний академіком РАО, академіком АПСН, іноземним членом НАПН України, почесним доктором Софійського Університету імені Святого Климента Охридського (Болгарія), почесним доктором Хмельницького національного університету (Україна, м.Хмельницький), почесним професором Національного педагогічного університету ім. М.П.Драгоманова (Україна, м.Київ) та Південноукраїнського національного педагогічного університету ім. К.Д.Ушинського (Україна, Одеса), почесним професором Тюменського, Дагестанського, Уральського (Казахстан), Нєфтєкамського державних університетів, Новосибірського, Челябінського, Самарського та ін. педагогічних університетів; доктор психологічних наук, професор Московського міського педагогічного університету, керівник Міжнародного Центру Гуманної Педагогіки (з 2001р.), який щорічно проводить Міжнародні Педагогічні Читання, Лицар Гуманної Педагогіки. Міжнародна Асоціація Дитячих Фондів нагородила Ш.О.Амонашвілі почесною золотою медаллю ім. Л.М. Толстого.